今後生物統計学を履修したいと考えている若い人たち向けの米国の生物統計学コースを有する大学の紹介の第十弾は、米国ルイジアナ州ニューオーリンズにあるテュレーン大学です。
Department of Global Biostatistics and Data Science, School of Public Health and Tropical Medicine, Tulane University
テュレーン大学のロゴ
１．ルイジアナ州とニューオーリンズの位置
２．ルイジアナ州ニューオーリンズ市（New Orleans）
ルイジアナ州南東部の都市ニューオーリンズは、米国南部の最も特徴的な都市のひとつであり、北アメリカの豊かな水源であるミシシッピ – ミズーリ川の河口に開けた大都会です。また、その戦略上重要な立地は、北米の支配のためにヨーロッパ人の争いに拍車をかけてきました。その結果、ニューオーリンズの人々は、同時に多くの遺産を融合しながら、独自の文化と社会を進化させて来ました。特にアフリカ系民族はニューオーリンズをジャズの発祥地にする多大な貢献を遂げて来ました。
ニューオーリンズは、明暗差の大きな都市となりました。他の米国の都市と同じく大都会の問題を共有していますが、有名なリオのカーニバルなどと並ぶ世界で最も有名な謝肉祭（カーニバル）のひとつのマルディグラでは、最高潮に達する時期は100万人以上の人々が街を埋め尽くします。そして、ルイジアナで最大の都市であり、最も重要な港の一つであり、主要な観光地、医療、工業、教育の中心地です。しかし、2005年8月にハリケーン・カトリーナに襲われ、市を守っている堤防が破られ、ほぼすべての市街地が浸水しました。嵐とその余波により数百人が命を落とし、大規模な財産の被害に加え、大都市として本格的な住民の避難を余儀なくされた大災害となりました。米国南部有数の華やかな都市でありながら、一方で大きな傷跡を残したままとなっています。
ニューオーリンズ市風景
https://www.charterflightgroup.com/new-orleans-private-jet-charter/
都市のレイアウト
ニューオーリンズ市とオルレアン教区（郡）は同じ広がりを持ち、メキシコ湾のミシシッピ川デルタの一角を占めています。この都市はミシシッピ川で２つに大きく分かれており、もともとの開拓地は堤防の東岸に位置していますが、近年はアルジェと呼ばれる西岸が急速に成長しています。ニューオーリンズ郊外の橋（クレセントシティコネクションとも呼ばれます）によってニューオーリンズの東西が接続されています。1958年に完成したこの橋は、街の交通のボトルネックとなっていましたが、渋滞を緩和するように設計された第2の隣接橋が1988年に完成しています。
初期の都市は、ミシシッピの急な曲がりに沿って東岸に位置し、そこから「Crescent City」というニックネームが付けられました。現代のニューオーリンズ市は、この元の場所をはるかに超えて広がっています。その土台型の地形は、海抜が1.5〜3メートルと低く、平均降水量が1,400 mmと多いので、堤防や堤防システム、適切な排水は常に重要な機能として重視されてきました。この様に強力な嵐が低層都市を氾濫させることが長い間懸念されていましたが、ハリケーン・カトリーナによって現実となり、さらに一ヶ月も経たないうちに、西へ渡った第2のハリケーンによって、いくつかの堤防が再び決壊し、都市のいくつかの地域が再び洪水に見舞われたことは記憶に新しい悲劇です。
気候
ニューオーリンズは穏やかな気候です。 10月から3月までの日平均気温は16°Cで、4月から9月までの平均気温は25°Cです。氷点下気温はまれで、35°Cを超える真夏日も年間約6日間程度しかありません。
人口
ニューオーリンズの人口は減少傾向を示しています。特にオルレアン教区の人口減少が進んでいますが、一方でオルレアン教区の人口減少とは対照的に、オルレアンと一緒になったセント・バーナード、プラクエインズ、ジェファーソン、セント・チャールズ、バプテスト聖ヨハネ、サン・タマニーの近隣の教区はニューオーリンズの首都圏として人口は着実に増加しているようです。ほとんどの隣接する小教区のアフリカ系アメリカ人の人口は少ないので、これらの数字は1950年以来の大都市の大部分の典型的な郊外への白人移動の一般的な傾向を示していると思われます。
郊外への人口の変化は、より良くより現代的な生活施設の欲望よりも、人種的な緊張に動機付けされているとも言えます。アフリカ系アメリカ人の大部分が衰退している地域に住んでいるという事実は、これらの人々と異人種の政治的、社会的、宗教的組織が独立して働いていることの証しかもしれません。一方で、ニューオーリンズには上層階級と中流階級のアフリカ系アメリカ人も多く存在するという事実は、人種格差の問題を考える上で重要な要素となっています。
バーボンストリート
https://adoora.es/es/imagenes/bourbon-street-new-orleans-g588352876/
経済
ニューオーリンズは、主に商業の中心地であり、製造業は経済生活の中で第二の役割を果たしています。賑わいを見せる港は、この都市の国際的な雰囲気に加えて、都市生活の多くの側面に影響を与える首都経済の基礎となっています。近代的なニューオーリンズ港の時代は、1879年にSouth Passの堤防工事で幕を開けました。川の合流地点では砂洲が間隔を空けて形成されており、都市設立以来河川に入る船舶を妨害していましたが、川に30フィートの深さのより深い運河を掘り込み、その後第2のチャンネルであるSouthwest Passは、桟橋を設置することによって40フィート（12m）まで深くなりました。これが現在、川に出入りする海上船舶に使用されるメインパスとなっています。1896年に州議会が民間請負業者の管理から埠頭施設を除外し、ニューオーリンズ港委員会（ドック委員会）を設立した時から、港湾のもう一つの大きな一歩が踏み出されました。1908年にドック委員会は港湾施設の改善のために債券を発行する権限を与えられ、公共の埠頭の再建と拡張、川をポンチャートレイン湖に結びつける9kmの産業運河の建設、イントラコースタルウォーターウェイ、シシッピ川湾アウトレットなどのプロジェクトがスタートし、1963年にはミシシッピ川湾アウトレット（64kmに及ぶ湾への通路を短縮する船路）が海上交通に開放されています。今日では、多くの港湾活動がミシシッピ川から湾岸アウトレットに沿った埠頭や工業団地として栄え、河口は高層マンションや公共のレクリエーションエリアとして賑わいを見せています。特にこのエリアを代表する恒久的な建物は、ニューオーリンズのコンベンション＆エキシビジョンセンターと国際パビリオンです。
さらにニューオーリンズは米国と世界の主要穀物港となっています。その他の輸出物には、未加工および加工農産物、製作された金属、化学品、繊維、油、石油および石油製品、タバコおよび板紙が含まれます。1980年代初め以来、バルク輸出は大幅に伸びており、ニューオーリンズは船舶貨物や世界のバージ船のメッカになっています。穀物、石炭、動物飼料は、貿易の大部分を占めており、国際商取引では、毎年約5,000の外航船がニューオーリンズに停泊し、40か国以上が領事館を構えています。
業界
グレーター・ニューオーリンズ地区は主要な産業地域であり、ミシシッピ川に沿って石油化学プラントが集中し、米航空宇宙局（NASA）は1961年にニューオーリンズにMichoud Assembly Facilityを設立し、月への飛行に使用される巨大なロケットブースターを生産した歴史もあります。グレーター・ニューオーリンズ地区で製造される主な商品は、食品、衣料品および関連商品、石材、粘土およびガラス製品、主要金属および製造金属製品、輸送機器であり、また観光は重要な産業となっています。
しかし、ニューオーリンズの北のミシシッピ州に沿った石油化学産業とメキシコ湾の海上油田は、都市の飲料水を脅かしており、石油火災、石油スラック、水銀、ヒ素、鉛の排出によって深刻な環境汚染として河川や湾の生態系を危険にさらすことになってしまいました。問題となっている産業に対する連邦政府の対応で改善されてきていますが、いまだに多くの問題が残っています。
交通
ニューオーリンズの交通機関には、空港が欠かせず、最も主要なものは都市の西にあるルイ・アームストロング・ニューオーリンズ国際空港です。この空港名は2001年8月にニューオーリンズ出身の著名なアフリカ系アメリカ人のジャズミュージシャンのルイ・アームストロングの生誕100周年を記念して、モワザン・ストック・ヤーズ空港から改名されました。残念ながら、現在日本発ニューオーリンズ行きの直行便を運行している航空会社はありません。
さらにニューオーリンズではいくつかの鉄道が運行していますし、バス、トラック等の地上交通輸送は人と貨物を都市間に輸送しています。蒸気船ラインによる定期便の運航も、旅客および貨物運送サービスを提供しています。グレーター・ニューオーリンズ橋に加えて主要なアクセス橋には、ミシシッピ川を横切るヒューイ・P・ロング橋とレイク・ポンチャートレイン・コーズウェイ橋があります。レイク・ポンチャートレイン・コーズウェイ橋は世界最長の橋で、ほぼ39kmの長さを誇ります。ヒューイ・Ｐ・ロング橋は1935年の供用開始以来、70年以上もの間、ミシシッピ川を渡河する道路鉄道併用橋としてニューオーリンズ近郊における交通の大動脈の役割を担っていましたが、近年は、交通量増加と、老朽化が進んでいることから、2012年の工事によって拡幅・補強され、現在、上り、下り２車線がそれぞれ３車線に拡幅されています。
３．テュレーン大学
テュレーン大学は1834年に設立された私立大学で、総学部学生数は6,377人で、キャンパスの規模は110エーカーを誇ります。ニューオーリンズにあるこの大学は、メインのアップタウンキャンパスとヘルスサイエンスプログラムの中心地であるダウンタウンキャンパスに分かれています。学校には高い評価を受けているロースクールと米国内で唯一の「公衆衛生及び熱帯医学部」があります。新入生と二年生は原則としてキャンパスに住んでいなければなりません。学生はキャンパス内の200以上の学生団体に参加でき、約4分の1の学生が、Tulaneの約20の社会団体と友愛事業に関わっています。 テュレーン大学の女子学生はシンポジウムやゲストスピーカーを迎え、若い女性のための指導者を提供するNewcomb College Instituteを通じて特別なサポートを受けています。
テュレーン大学の校舎の風景
http://www.nolahomes.net/?tag=tulane-university-in-new-orleans
テュレーン大学の歴史は、ルイジアナ医科大学として設立された1834年にさかのぼります。それは1847年にルイジアナ大学と合併し、1880年代初めに慈善家のPaul Tulaneが寄付した後、1884年にTulane Universityに改称され、私立大学になりました。
今日では、建築、ビジネス、法律、リベラルアーツ、医学、公衆衛生と熱帯医学、科学と工学、ソーシャルワークのプログラムを含む10の異なるスクールの学位を提供しています。セント・チャールズ・アベニューにあるアップタウンのキャンパスは、1894年以来Tulaneの本拠地となっており、110エーカーのキャンパスに大学の学校やカレッジのほとんどを収容する92の建物があります。スポーツ施設では、Yulmanスタジアムがあり、最大3万人収容可能で、大学のGreen Wavesサッカーチームが試合を行う本拠地です。ヘルスサイエンスのキャンパスはダウンタウンにあり、国立霊長類研究センターはルイジアナ州コヴィントンにあります。継続教育のためのスクールはルイジアナ州のジェファーソン教区、ミシシッピ州のビロキシ、ミシシッピ州のマディソンにサテライトキャンパスを構えています。メインキャンパスに拠点を置くFreeman School of Businessは、テキサス州ヒューストンの衛星キャンパスでもプログラムを運営しています。1,180人の教員を含む全キャンパスに5,000人以上の従業員を抱え、民間におけるニューオーリンズで最大の従業員数を誇ります。
テュレーン大学遠景
http://www2.tulane.edu/news/newwave/080615_stronger_by_a_decade_tulane_and_nola.cfm
４．バイオ統計学及びデータサイエンス学科（GBDS）
生物統計学およびデータサイエンス学科（GBDS）は、様々な生物学的トピックに対する統計および/またはコンピュータ科学の応用を研究しています。この学科では、生物統計学やバイオインフォマティクスの研究焦点として、遺伝的およびゲノム的なデータを分析するための新しい方法論を開発することや実験計画、統計計算、およびデータ解析などの統計関連の問題を中心に研究者を支援し、論文化と助成の申請を支援することを掲げています。GBDSは独自の方法論的研究を行い、学際的な研究チームに協力し、生物統計学とバイオインフォマティクスの方法論と公衆衛生データ分析の応用における訓練や高品質のサービスを提供することにより、生物統計学、学術・研究および専門家のコミュニティを形成しています。
GBDSではバイオスタティスティックス、バイオインフォマティクス、ゲノミクス、生物医学情報学、大規模なデータとそのデータ分析（データの取得とデータ管理を含む）の専門知識を学習します。GBDSの教員は、強力な育成学習環境を提供することに大きな誇りを持ち、学生には非常にアクセスしやすい環境を整えています。また、共同研究や独立研究に積極的に関与しており、学内外の研究プロジェクトへの学生の参加を奨励しています。これらの研究チームは、学際的な研究チームを務め、統計的方法論、標本サイズ推定、データ解析、欠損データ処理技術、実験計画、ロバスト推定、生存分析、マイクロアレイデータ解析、ゲノミクスおよびプロテオミクスの専門知識を提供します。研究分野には、バイオスタティスティクスの手法と応用、癌、骨粗鬆症、呼吸器および心血管疾患、健康情報およびデータ分析、大規模なデータ収集、大規模な臨床試験のための管理分析に関するバイオインフォマティクスが含まれます。
大学校舎の一部
https://tclf.org/tulane-university
研究課題：
①複雑な形質遺伝子マッピングにおける次世代シーケンシングデータの有用性
技術の向上とコストの削減により、様々な生物学研究の研究者にとって全ゲノム配列決定の手頃な価格とアクセスの可能性が高まっています。遺伝子研究のために膨大な量の情報を提供しており、私たちの研究の焦点は、ゲノム全体の配列データから複雑な形質遺伝子をマッピングするための情報を使用するための統計およびバイオインフォマティクス手法を設計および開発することです。希少遺伝子変異の検出を改善するためのいくつかの戦略および疾患関連ゲノム領域の検出のための希少変異体の効率的な利用を提案して来ています。
②関連研究のための方法論開発と応用
関連研究は、一塩基多型（SNP）などの遺伝的変異体が複雑な形質または疾患と関連しているかどうかを試験することである。 特に、ゲノムワイド関連研究（GWAS）は、ゲノム全体にわたって多数の遺伝的変異体を使用する。 この分野における我々の研究は、関連分析における複数の相関形質の使用、集団基礎構造の補正、およびハプロタイプを用いた関連分析の実施を含む、様々な状況のための方法論開発に焦点を当てている。
③mRNA発現、プロテオームおよびエピゲノムデータのための方法論開発および応用
疾患状態の決定は、DNA変異体およびmRNAおよびタンパク質レベルの因子、ならびに/またはDNA修飾の両方によって影響される。 これらの生物学的レベルでの研究は、複雑な形質および疾患の遺伝的決定における洞察を提供する。 mRNAおよびタンパク質発現データおよびゲノム全体のメチル化などのエピゲノムデータを解析するために、我々は、ベイズ誤差に基づくマイクロアレイ発現データの分類およびマイクロアレイデータの差次的発現を検出するための多変量プロファイリングなどの様々なアプローチを開発し続けている。
③様々な民族集団間の遺伝的変異の研究と比較
遺伝的変異は、特定の民族グループだけでなく、異なる民族グループの間でも、疾病の決定に重要な役割を果たす。 骨粗鬆症のような多数の複雑な疾患は、異なる集団において異なる発生率を有することが観察されている。 しかし、その違いは環境要因によるものであり、どの程度遺伝的要因が完全に理解されていないかによる。 様々な民族集団のデータを用いて、これらの異なる民族集団内および集団間の遺伝的変異を研究し、比較する。 例としては、白人とアジア人の間のDNA変異の多様性、および遺伝的変異の相違が疾患の状態に及ぼす影響が挙げられます。
④遺伝学およびゲノム研究のための統合データ解析
生物学的データの複雑さに起因して、多くの分析は1レベルのデータを用いてのみ行われる。例えば、DNA変異体データ、mRNA発現レベル、およびタンパク質発現データは、通常、別々に分析される。しかしながら、これらのデータは本質的な関係を有することができ、それらを同時に考慮すると、遺伝子検出においてより大きな力を提供することができる。 私たち自身の研究とコラボレーションを通して、DNA変異体やmRNA発現レベルなどの異なる生物学的レベルのデータを単一の分析フレームワークで組み合わせることに取り組んでいます。 この研究の成果は、遺伝学的研究とゲノム研究の能力を向上させるでしょう。
参考のため、修士課程のプログラムを下記に紹介します。
すべてのMaster of Public Health and Tropical Medicine (MPHTM) の学生はSchool of Public Health and Tropical Medicine （SPHTM）のコア（15単位）と熱帯医学基礎（11単位）のコースを受講します。さらに、学生は公衆衛生や熱帯医学の臨床的側面に焦点を当てて学ぶことができます。公衆衛生学には病気の予防と管理、熱帯地域の微生物病および影響評価（6単位）に関するコースが含まれます。臨床的分野においては、熱帯病（5単位）の診断と治療の訓練を含み、これらのコースを修了する医師は、熱帯医学と衛生学のアメリカ学会が提供する臨床熱帯医学と旅行者の健康管理技術の認定試験を受ける資格が得られます。
コース内容：
１．SPHTM Core Course Requirements (15 credits)
BIOS 6030 Introductory Biostatistics (3)
EPID 6030 Epidemiological Methods 1 (3)
GCHB 6030 Social and Behavioral Aspects of Global Health (3)
GEHS 6030 Survey of Environmental Health (3)
GHSD 6030 Introduction to Health Systems Administration and Management (3)
２．Program Course Requirements (20 or 16 credits)
TM Foundation Courses (11 credits)
TRMD 6050 Medical Helminthology (2)
TRMD 6070 Medical Protozoology (2)
TRMD 6090 Parasitology Laboratory (2)
TRMD 6330 Microbial Diseases of the Tropics (2)
TRMD 6350 Disease Prevention & Control in Developing Countries (2)
TRMD 7000 Trop Med Seminar or
TRMD 7020 Infectious Disease Seminar (1+1)
さらに、次のいずれかを履修します。
１．Public Health Focus (9 credits)
TRMD 6010 Biological Basis of Disease (3)
TRMD 6060 Medical Entomology (3)
TRMD 6200 Impact Evaluation in Global Health (3)
OR
２．Clinical Focus (5 credits)
TRMD 6310 Clinical Tropical Medicine (2)
TRMD 6340 Diagnostic Lab Methods in Microbiology (2)
TRMD 6360 Clinical Tropical Medicine Case Presentations (1)