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2018.11.01
生物統計学コースのある米国の大学紹介-その12(バンダービルト大学)

今後生物統計学を履修したいと考えている若い人たち向けの米国の生物統計学コースを有する大学の紹介の第12弾は、米国テネシー州ナッシュビルにあるバンダービルト大学です。

Department of Biostatistics, School of Medicine, Vanderbilt University

 

バンダービルト大学のロゴ

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1.テネシー州とナッシュビル市の位置

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https://www.worldatlas.com/na/us/tn/where-is-nashville.html

 

2.テネシー州ナッシュビル市

 ナッシュビル市はテネシー州の州都(1843年より)であり、州の北部中央部のカンバーランド川沿い位置しています。ナッシュビル市は、またデイビッドソン郡を含む周辺の7つの郡を抱合する都市化されたメトロポリタンの中心都市でもあります。1963年以来、ナッシュビル市とデイビッドソン郡の行政が統合され、現在では郡全体をカバーする総合サービス地区と、ナッシュビル市を含む都市サービス地区で構成されています。

 

ナッシュビル市遠景

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https://www.flickr.com/photos/digitalvu/23320657472

 

ナッシュビル市の歴史

 ナッシュビル地区にはもともとミシシッピ文化の人々が住んでいました。アメリカ先住民のチェロキー 、チカソー 、ショウニーなどの部族の人々が、後にこの地域に移住しています。ナッシュビル市は1806年に都市化され、テネシー州中部の河川による貿易拠点及び製造拠点として発展し、この地域の政治の中心となりました。 その商業的重要性は、1850年代の鉄道の出現によってさらに高まりましたが、南北戦争においてナッシュビルは1862年2月に北軍に占領されるという悲劇に見舞われています。この南北戦争はナッシュビルの経済に多大な打撃を与えましたが、戦争の終結とともに急速に再発展をとげることが出来ました。戦後数年でナッシュビルは河川を利用した水上および鉄道輸送の要衝の地位を回復し、製造業も再び大きな発展を遂げることが出来ました。ダウンタウン周辺に今も残る古典様式の大邸宅は、バンダ―ビルト大学創立のために多額の寄付を行った船舶や鉄道の大実業家であるコーネリアス・バンダービルトを含め、19世紀終わり頃のナッシュビルの繁栄を気づいた人たちの栄華を今に伝えています。

 ナッシュビルの南北戦争後の復興は、1866年と1873年に深刻なコレラの流行を経験しましたが、地域の鉄道と水道網の中心的な位置を占め、そこに設立された多くの高等教育機関の貢献から、「南部のアテネ」のニックネームで呼ばれるようになったナッシュビルの経済と人口は、20世紀初めに急速に成長し、さらにその間にアメリカの伝統音楽やカントリー・ミュージックの中心地として大きく浮上しました。ナッシュビルの産業発展は、 テネシー渓谷とカンバーランド川のダムから安価な電力が利用可能になった1930年代に加速しましたが、2010年5月の2日間の豪雨の後にカンバーランド川が氾濫し、都市部の大部分に大きな被害をもたらし、多くの命が奪われる悲劇を体験しています。

 

美しきナッシュビル市の夜景

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https://lifehacked1st.com/page/4041/

 

現代のナッシュビル市

 近代経済が多様化する中で、音楽と娯楽産業がナッシュビルの主要な産業となるとともに、医療、金融と保険、教育などの多様なサービスが経済の重要な貢献者となっています。製造業(自動車、自動車ガラス、トラック、タイヤ、給湯器、航空機部品、電化製品など)、印刷出版(特に音楽や宗教)、観光なども重要産業です。市内の中心部には国際空港、カンバーランドの港湾施設、鉄道と高速道路の接続が整備されているため、流通と交通の中心であり、さらにこの地域の農業では、タバコ、家畜、乳製品、トウモロコシ、大豆などの豊富な作物が収穫できます。

 ナッシュビルは世界中で知られているカントリーミュージックの大規模な録音業界の基盤都市となっています。その活動の多くは、Music Rowと呼ばれるダウンタウンのエリアに集中しており、この地区にはカントリーミュージック殿堂博物館やオペラ座の原点であったコンサート会場 Ryman Auditoriumなど、音楽に関連する数多くの観光スポットが存在しています。Grand Ole Opryのラジオ番組は、ダウンタウンの東に位置するホテルやショッピング施設を含む複合施設の一部であるOpry Houseで直接見ることができ、6月に毎年開催される国際カントリーミュージックファンフェアでは、ファンが好きなミュージシャンの声を聞いたり、会ったり、サインをもらったりすることができます。

 さらに、ナッシュビルは教育的で宗教的な中心地のままであり、世界でも最大規模のユナイテッドメソジスト出版社を含むいくつかの企業や団体がここに本部を置いています。高等教育機関は、宗教系の大学としてフィスク大学 (1866年、合同教会)、ベルモント大学(1890年、テネシー南部バプテスト大会)、リップスコブ大学(1891年、キリスト教会)、トレベッカ・ナザレ大学(1901年)、アクィナス大学; カトリックローマン)などが設立され、総合大学としてナッシュビル市にはバンダービルト大学 (1873年)、メハーリー医科大学(1876年)、テネシー州立大学 (1912年)、ナッシュビル州立技術研究所(1970年)が創立されています。

 ナッシュビルのセンテニアルパークには、1897年のテネシー百周年博覧会のために建設されたパルテノン (アテネの寺院)があり、そこに位置するアテーナの像は高さ13メートルにもなります。米国独立200周年記念キャピトルモール州立公園には、第二次世界大戦の記念碑としての黒い花崗岩製の地球が展示されています。

 また、この都市には、交響楽団、オペラ会社、バレエ団、劇団があります。歴史、芸術、科学の博物館もあり、ナッシュビルはナショナルフットボールリーグ:タイタンズとナショナルホッケーリーグ:プレデターズの本拠地です。ラドナー湖州自然公園とロングハンター州立公園も近くにあります。

 

3.バンダービルト大学

 バンダービルト大学は1873年に設立された私立大学で、学部生は6,885人、キャンパスの規模は333エーカーを有しています。Best Collegesの2019年版のランキングは全米で14位で、授業料と入学費は$ 49,816(2018-19)かかります。同大学は幅広い学生活動を行っており、キャンパス外でもナッシュビル市、人呼んでミュージックシティには、食事、ショッピング、音楽、エンターテインメントのための多くのオプションがあります。キャンパスでは、学生寮の組織は学生生活に大きな役割を果たし、約40%の学生が学生寮の生活を送っています。また、学生の40%以上が、40カ国以上で提供されている大学の海外留学プログラムを利用しています。

 バンダービルト大学は、人文科学から音楽、工学までの分野をカバーする10の学部とカレッジで構成されています。その大学院プログラムの中には、トップクラスのPeabody College of Education and Human Developmentがあり、一部学部のプログラムも提供しています。オーウェン大学院経営学科、工学部、法科大学院、医学部、看護学部など、多くの学部が高く評価されています。バンダービルト大学はまた、ブレア音楽学校でよく知られており、さらに医療センターは医療機関として全国で最高のランク付けを受けています。

 

大学のキャンパス

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https://ticua.org/page/about

 

生物統計学科について

 バンダービルト大学の生物統計学科は2003年に設立され、バンダービルトコミュニティに生物統計学的専門知識をもたらすという使命をもって開設されました。医学部の支援並びに研究員とスタッフの勤勉さと創造性を基盤に、毎日使命を果たしています。最先端の統計的方法論研究に従事し、生物医学基礎研究者や新しい世代の生物統計学者を養成しています。今日では、開設以来10年以上経っており、新しい時代を迎えるにあたり、生物統計学者は伝統的な統計的モデリングや推論を超えて、さらなるスキルと知識を広げようとするビッグデータの時代、すなわち膨大な数の構造化データおよび非構造化データを駆使し、正確な医学に通じるパターンを見つけて予測することができるようになっています。この新しい時代に学ぶ機会を受け入れることに興奮しており、それぞれの新しい挑戦を一緒に満たすことを楽しみにしています。

 

 バンダービルト大学の生物統計学科のメンバーとして、私たちは生物医学研究の最前線に立ち、医療における知識に貢献する統計データ科学者を要請します。学科の教授達は、生物統計学の方法論の独立した研究者で構成されています。同様に重要なのは、医学研究者と協力して、病気、治療法、患者アウトカム、および生物学に関する好奇心と統計的専門知識をもたらすことです。バンダービルト大学の生物統計学者は医師・他学部の科学者との相談に応じたりするほか、医学を発展させる主題の長期的な連携を重視しています。

 

具体的な目標

 生物統計学科の方法論的研究は現実の問題を解決しながら最先端の研究を行っています。柔軟な実験デザインを開発または選択し、研究の倫理的実施を強化し、より費用対効果の高い方法で研究を行い、生物学的または医学的関連性に関してエビデンスを構築します。今日の問題に最先端の統計的およびデータ科学的手法を適用するとともに、ジャーナル・クラブや研究会議への参加、コラボレーションに適したその他の活動を通じ、医学部の他の部門の研究プログラムと完全に統合された活動を行っています。

 この様に、生物統計学科は新しい柔軟性と堅牢な分析手法を重視した現代の応用統計とデータ科学の手法に基づいて、一流の大学院プログラムを運営し、プロトコール違反、データ欠落、観察研究における治療選択バイアス、および歪んだ分布に起因する乱雑なデータに対処するためのさまざまなアプローチを駆使して、高度に柔軟で逐次的で適応性のある実験デザインを提供します。数学的な優雅さよりもむしろ問題解決に焦点を当てた統計的方法とデータ科学的方法論を開発することを目指しています。

 

基本姿勢

● モダンな最新の統計的コンピューティングツールを利用して最新の分析手法を実装する。

● 再現性のある研究を実践する。

● 医学を発展させるテーマ別の長期的な協力を目指す。

● オープンソースソフトウェアの使用を強調し、それらのコミュニティが我々に与えてくれたことを認識してコンピューティングおよび科学オープンコミュニティに還元する。

 

生物統計学科が提供するもの

● 公衆衛生を改善し、生物学の理解を高め、生物学的および医学的診断を最適化することによって動機づけられる

● 研究者とのインタラクティブなやりとりによる実験計画の立案する。

● データ収集の強化を行う。

● できるだけ多くの変動要因を考慮する。

● 背景情報を標準化して調整し、可能であればこれらの調整を一次分析に組み込む。

● 綿密に関連性を分析する。

● 予測とモデルを徹底的に検証する。

● 結果を解釈し、臨床実践と生物学的研究への応用を促進する。

● 可能な限り倫理的な人間と動物の実験を支援する。

● 柔軟性と思考の統制を維持し、偏見や誤解を克服するための協力グループの形成と運営を支援する。

 

生物統計学科のビジョン

 生物統計学は、生物医学において生み出された科学的データの適切な解釈を担う統計学の技術です。これらの科学において、被験者(患者、マウス、細胞など)は、刺激に対する応答においてかなりの変動を示します。この変化は、異なる治療に起因する可能性があり、または個々の対象の偶然性、測定誤差、または基礎となる特性に起因する可能性があり、生物統計学は、特にこれらの異なる変動要因を解きほぐし、相関と因果関係を区別し、既知のサンプルから有効な推論を行うことに関心があります(例えば、患者が2つの異なる治療法で治療される場合、結果は、1つの治療法が他の治療法より優れているという結論を正当化するか?)。

 

紅葉が美しいキャンパス

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https://www.thesecu.com/sec-universities/vanderbilt-university/

 

生物統計学者とは何か

 生物統計学者は、科学的証拠としてのデータ評価の専門家です。彼らはデータの一般的な構成を理解し、結果を一般化するために科学的文脈を超えた数学的枠組みを提供します。言い換えれば、生物統計学者は数学を使って科学を高め、理論と実践との間のギャップを埋めることに尽力します。彼らの専門領域には、実験の設計と実施、データを収集する方法とその実践、データの分析、結果の解釈が含まれます。

 生物統計学は、生物学、健康政策、臨床医学、公衆衛生政策、健康経済学、プロテオミクス、ゲノム学、その他の分野における知識の進歩に不可欠です。ビッグデータと精密医学の時代に、生物統計学者はデータ科学者として特に重要な役割を果たしています。

 精密医学の重要な概念は、個々の分子プロファイルと臨床情報を考慮に入れた予防と治療戦略です。近年、循環型腫瘍DNA(ctDNA)、マイクロバイオミクス、ラジオミクス、その他のハイスループットアッセイ用の単一細胞の次世代シークエンシング技術(NGS)などが、巨大な大量のデータを迅速かつ低コストで収集できるようになりました。これらの大きなデータの出現は精密医学の目標を進化させましたが、大量のデータを利用するまでには、ハイスループットなバイオマーカーの分析から電子健康記録(EHR)の最大限の活用、患者のゲノムに基づく臨床指導の最終的な目標まで、さらに多くの課題が山積しています。

 

データ科学者としての生物統計学者

 バンダービルト大学では、生物統計学者は、統計科学の進化する状況を理解しています。方法論上の専門知識を提供し、科学者や医師・研究者と密接に協力して生物医学研究を促進するだけでなく、データ革命のリーダーでもあります。方法論から応用、教育に至るまで、彼らはデータサイエンスの概念を取り入れ、データからエビデンスを抽出する能力を向上させ続けています。膨大な量のデータが爆発的に増加することから、非構造化テキストを量的データとして扱い、機械学習、人工知能のアプリケーションの急増に至るまで、ビッグデータ時代の課題と生物医学的知識の進歩の機会を歓迎しています。

 

博士課程

 PhDの候補者は、下記の5つの分野で優れたスキルを発揮する必要があります。これは、満足のいくコースワーク、各部署の診療への参加と学際的な協力、研究助手への関与、包括的試験の2セット、博士号取得試験、口頭での論文の諮問、そして様々なプレゼンテーションと部門でのセミナーなど、全米の博士号取得生物統計学者候補の最高に位置するため、これらのスキル分野のそれぞれに強い熟練を示すことが期待されます。

 5つの分野とは、(1)理論、(2)応用、(3)批判的思考、(4)コミュニケーション(口頭および書面)、および(5)実践的な能力であり、全てにおいて力を発揮しなければなりません。プログラムのカリキュラムは、方法論的および理論的な設定でこれらのスキルを導入し、強化し、洗練させるように設計されています。

 

博士課程の要件とコーススケジュール(PhD)

生物統計学の博士課程(PhDコース)の卒業要件は次のとおりです。

●  72時間のカリキュラムとリサーチ・クレジットを完了する(通常、3年目の終わりまでに完了すること)。

● 各コースにおいて、少なくとも10の中核となる博士課程コースを修了する必要がある。

●  3.0(B)以上の総合GPAを維持する。

●  統計または生物医学の科目で選択科目の少なくとも8つのコース(24単位時間)を履修する。

●  博士号レベルでの第1年次および第2年次の総合試験に合格すること。

●  学際的な研究のローテーションを完了すること。

●  博士号取得の口頭試験に合格すること(通常3年次に修了すること)。

●  生物統計学の学問の知識を向上させるオリジナルな研究と方法論的な成果を詳述した博士論文を提出すること。論文の研究は、生物統計学的性質に関する論文化可能な質の高い研究でなければならない。

●  部門セミナーで現在の論文の所見を発表すること。これは、学位取得のために入学してから4年以内に修了すること。学生は、3年目の秋に生物統計学で口頭審査を受ける資格試験に合格した後、大学院入学を認められる。

 

1年目の秋と春の課題:

●  1年次総合試験(5月末)

●  現代のバイオ統計学の原理

●  現代の回帰分析

●  確率の基礎

●  現代の統計的推論

●  統計コンピューティング入門

●  臨床試験(または同等の選択肢)

●  疫学理論と方法(または同等の選択肢)

 

2年目の秋と春の課題

●  2年次総合試験(5月末)

●  高度回帰分析I(L&GLM)

●  高度回帰分析II(GLM&LDA)

●  健康科学における統計的コラボレーション – 第1部

●  健康科学における統計的コラボレーション – 第2部

●  応用生存解析

●  回帰モデリング戦略(または同等の選択肢)

●  高度な確率とRAの概念

●  高度な統計的推論

 

3年目の秋と春の課題

●  口頭審査(3年次の冬/早春)

●  高度な統計コンピューティング(または同等の選択肢)

●  推論の基礎(1年おきに提供)

●  ベイジアンメソッド

●  学位論文研究

●  学位論文研究

 

4年以上の秋と春の課題

●  博士論文の作成と諮問

 

広大な大学キャンパス

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https://www.princetonreview.com/college/vanderbilt-university-1022817

 

修士課程の要件およびコーススケジュール(MS)

生物統計学における修士課程(MSコース)の卒業要件は次のとおりです。

● コアコースの少なくとも8つのコース(32単位時間)を履修すること。

● 8つのコアMSコースのそれぞれに、少なくとも各コースのC +を取得すること。

● 3.0(B)以上の総合GPAを維持すること。

● 統計または生物医学分野の科目で少なくとも4科目(12単位時間)の選択科目を履修すること。

● MSレベルで初年度総合試験に合格すること。

● 学際的な研究のローテーションを完了すること。

● 生物統計学の分野でオリジナルな調査を詳述する修士論文を提出すること。調査は理論的であるか、自然界に適用される可能性があり、公開可能な研究でなければならない。

● 部門セミナーで論文の所見を発表すること。

 

1年目(MS)の秋と春

● 1年次総合試験(5月末)

● 現代のバイオ統計学の原理

● 現代の回帰分析

● 確率の基礎

● 現代の統計的推論

● 統計コンピューティング入門

● 臨床試験(または同等の選択肢)

● 疫学理論と方法(または同等の選択肢)

 

2年目(MS)の秋と春

● 論文研究と発表

● 高度回帰分析I(L&GLM)

● 高度回帰分析II(GLM&LDA)

● 健康科学における統計的コラボレーション – 第1部

● 健康科学における統計的コラボレーション – 第2部

● 応用生存解析

● 回帰モデリング戦略(または同等の選択肢)

● 論文研究